2005年11月8日，莫納漢和合作的演員伊凡潔琳·莉莉（Evangeline Lilly）被拍攝到親密接吻的照片，並在許多雜誌和網站上刊載。至2006年8月9日，兩人並未公開他們之間的關係，莉莉表示「關於我們正在交往這件事只是謠言... 多明尼克是一個很棒的人。」 莫納漢也是一位積極的環境保護人士，他參加種植樹木和保護森林的活動，並在印度擁有一小片森林。 莫納漢在右手臂上有一個精靈語數字「9」的刺青圖案，是因為他在《魔戒三部曲》電影中的參與，他的角色（梅利）是9名護戒使者的其中之一。一些其他的角色也在電影拍攝期間刺了相同的刺青。在他的左手臂上有另一個寫著「Living is easy with eyes closed」（閉上眼睛的生活很輕鬆），這是出自披頭四（The Beatles）歌曲《Strawberry Fields Forever》中的歌詞。在《LOST檔案》中，查理手指上的繃帶分別寫著英文字母並能組合成一個單字，這是莫納漢提出的構想，他認為查理作為一個表演者，就算他流落到熱帶荒島上也想要表達自己的想法。莫納漢在該劇中也實際彈奏了吉他，並在《Jimmy Kimmel Live》節目中，和 Kimmel 合力創作了一首歌曲，歌詞寫道「我們在荒島迷失，我們離家遙遠；我們在荒島迷失，但我們並不孤獨...」 莫納漢也在一部以《魔戒》系列支持者為主題的記錄片《Ringers: Lord of the Fans》中擔任旁白。
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